Мисията на Висшия ислямски институт е да подготвя високообразовани ислямски теолози, които познават в дълбочина ислямското учение, служат на мюсюлманската общност в България и допринасят за взаимното разбирателство и уважение в българското общество.
Цели
- Да осигурява качествено висше образование по ислямска теология, основано на класическите ислямски науки и на съвременните научни методи.
- Да подготвя имами, проповедници и учители по религия „Ислям“ с добра педагогическа и практическа подготовка.
- Да съхранява и изследва историята и културното наследство на мюсюлманите в българските земи.
- Да развива научноизследователска дейност в областта на ислямската теология и култура.
- Да поддържа сътрудничество с теологични факултети и университети в България и в чужбина.
- Да възпитава студентите в дух на толерантност, диалог и гражданска отговорност.